在山区和丘陵区域拦河筑坝水库结构有差异，水文地质条件比较复杂，初步设计推荐采用防渗效果较好的复合土工膜全库盘防渗方案，考虑库区位于泉水溢出带，岸坡和库底膜下均设置了纵横向的排水暗渠，膜上设置了0.6~1.5m的砂砾石保护层。
因为水库泉水溢出带下部为砾岩层，阻止了地下水的入渗，泉水溢出带出露位置高，涉及岸坡影响范围较长，布置纵横向排水设施工程量大，且岸坡垂直落差10~18m极易沿排水暗渠集聚水头对库盘铺膜产生顶托破坏。土工膜防渗结构自身也不稳定，因此左库岸边坡不宜采用大面积的铺盖式防渗措施。
由于泉水溢出量较大，强透水层出露位置较高，分区上防渗的意义不大，河床坝基存在强透水地层，但厚度不大，水库渗漏量及坝基渗透稳定也容易控制，采用沿主副坝坝基垂直防渗方案，相较库盘水平防渗方案不存在防渗结构破坏的安全风险，垂直防渗形式上结合主坝混凝土面板和副坝土工膜斜墙防渗，在前坝坡坡脚位置采用槽孔混凝土防渗墙的施工技术方案。其施工质量更容易控制。左岸泉水溢出带在坝址断面存在绕坝渗流的卵砾石夹层，采用坝基防渗墙向岸坡的延伸方案，以防止绕坝渗流对坝体及下游岸坡的渗流破坏为原则。